Бесперебойная работа двигателя Д-108 в значительной степени зависит от состояния системы охлаждения. При неисправной системе охлаждения либо при её некачественном техническом обслуживании возможен перегрев двигателя. В случае перегрева двигателя при отсутствии охлаждающей жидкости (воды) в системе охлаждения, запрещено заливать в радиатор холодную воду (охлаждающую жидкость), потому что это может повлечь за собой возникновение трещин в рубашках цилиндров либо в головках.
Систему охлаждения требуется периодически опорожнять для удаления скопившихся осадков и грязи. Это необходимо делать в конце рабочего дня, когда частицы грязи находятся во взвешенном состоянии и сольются вместе с водой. Одновременно нужно снимать крышку на задней стороне блока пускового двигателя для того чтобы удалить осадки из водяной рубашки.